RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	CEP250	Q9BV73	2442 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCC1-208	ENST00000576557	CLUH	O75153	1309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TSPAN1	O60635	241 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	MTR	Q99707	1265 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	AKAP5	P24588	427 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ID4	P47928	161 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FOXK2	Q01167	660 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	DSC1	Q08554	894 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	POTED	Q86YR6	584 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	STAM	Q92783	540 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557		R4GN57	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TGM5	O43548	720 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NR1I2	O75469	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CDKL5	O76039	1030 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	EFEMP2	O95967	443 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	AXL	P30530	894 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PTEN	P60484	403 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	DSG1	Q02413	1049 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557		A0A087WWV3	80 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TBX3	O15119	743 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	B4GALT5	O43286	388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SLITRK3	O94933	977 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NPTXR	O95502	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SRF	P11831	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	LAMP2	P13473	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CUL4A	Q13619	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CAPS	Q13938	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TFDP1	Q14186	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	AMHR2	Q16671	573 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23

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