RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 RUBCNLQ9H714 662 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D17Q9HA65 648 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 KCNK12Q9HB15 430 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 AAASQ9NRG9 546 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 TOR4AQ9NXH8 423 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 CDH22Q9UJ99 828 aa6□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 PSAPP07602 524 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 LAMC2Q13753 1193 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 MAF1Q9H063 256 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRIM25-208ENST00000574234 MAP4K1Q92918 833 aa5.98□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 CEP95Q96GE4 821 aa5.98□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 TCF25Q9BQ70 676 aa5.98□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.98□□□□□ -1.45
TRIM25-208ENST00000574234 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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