RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 KLK14Q9P0G3 267 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.17■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 FSD2A1L4K1 749 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 H0YCG3 227 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 FSCN2O14926 492 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 INPPL1O15357 1258 aa23.16■■□□□ 1.3
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SNAP23-216ENST00000568331 EDN1P05305 212 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 CA8P35219 290 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 DDIT3P35638 169 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 SCNN1GP51170 649 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 COL19A1Q14993 1142 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 USP49Q70CQ1 688 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 IGSF21Q96ID5 467 aa23.16■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 ZFP42Q96MM3 310 aa23.16■■□□□ 1.3
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SNAP23-216ENST00000568331 BMP1P13497 986 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 OR1G1P47890 313 aa23.15■■□□□ 1.3
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SNAP23-216ENST00000568331 EFHBQ8N7U6 833 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.15■■□□□ 1.3
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SNAP23-216ENST00000568331 SNTG2Q9NY99 539 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 STK17AQ9UEE5 414 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 STK39Q9UEW8 545 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.15■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.14■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.14■■□□□ 1.3
SNAP23-216ENST00000568331 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
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SNAP23-216ENST00000568331 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.14■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.14■■□□□ 1.29
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SNAP23-216ENST00000568331 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 VPS52Q8N1B4 723 aa23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.13■■□□□ 1.29
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SNAP23-216ENST00000568331 FAM50BQ9Y247 325 aa23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 GDAQ9Y2T3 454 aa23.13■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 LINC01565O15544 149 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNAP23-216ENST00000568331 CXCL14O95715 111 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNAP23-216ENST00000568331 STAT6P42226 847 aa23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 GIT2Q14161 759 aa23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 DUSP6Q16828 381 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNAP23-216ENST00000568331 SV2BQ7L1I2 683 aa23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 HIDE1A8MVS5 230 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 SCP2P22307 547 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 LTBRP36941 435 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 NCKAP1LP55160 1127 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 DSC1Q08554 894 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 BECN1Q14457 450 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 ATL3Q6DD88 541 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB33Q86T24 672 aa23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SNAP23-216ENST00000568331 BICD1Q96G01 975 aa23.11■■□□□ 1.29
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