RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PQ27 194 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PQ64 194 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PQD8 194 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARL5CA6NH57 179 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGB1P05556 798 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IDEP14735 1019 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PFKFB1P16118 471 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PROZP22891 400 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM9Q9C026 710 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDT1Q9H211 546 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARP2Q9UGN5 583 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBX20Q9UMR3 447 aa24.33■■□□□ 1.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDH23Q9H251 3354 aa24.33■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOM1L1O75674 476 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCF2P10911 925 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP5P24588 427 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTF2BQ00403 316 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE3AQ05086 875 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAMQ92783 540 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HVCN1Q96D96 273 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICD1Q96G01 975 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PANK4Q9NVE7 773 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP25Q9UHP3 1055 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPSEQ9Y251 543 aa24.32■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1B0GVL5 298 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABLIM1O14639 778 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRM6O15303 877 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FGF18O76093 207 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RECQL4O94761 1208 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIGRP01833 764 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCAR1P56945 870 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFP42Q96MM3 310 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCHPQ9BT92 498 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNTG2Q9NY99 539 aa24.31■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POMCP01189 267 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLFN14P0C7P3 912 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRM5P41594 1212 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIG4P49917 911 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCNN1GP51170 649 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASIC1P78348 528 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLCB3Q01970 1234 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIK3Q13003 919 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALCAMQ13740 583 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPG21Q9NZD8 308 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.3■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R37O75864 691 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PBX3P40426 434 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYKP43405 635 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB33Q86T24 672 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FSIP1Q8NA03 581 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POF1BQ8WVV4 589 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GBP3Q9H0R5 595 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLK14Q9P0G3 267 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LZTS1Q9Y250 596 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GDAQ9Y2T3 454 aa24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDN3O15551 220 aa24.28■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDHD2O94830 711 aa24.28■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCL1Q07820 350 aa24.28■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COASYQ13057 564 aa24.28■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms