RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 EPC2Q52LR7 807 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 USP49Q70CQ1 688 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CABP7Q86V35 215 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TMEM192Q8IY95 271 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 LRRC15Q8TF66 581 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CLIC6Q96NY7 704 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 RNF19AQ9NV58 838 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 DNM3Q9UQ16 869 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.11□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TTC3P53804 2025 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 SFI1A8K8P3 1242 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ASAP2O43150 1006 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 B4GALT5O43286 388 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EYA4O95677 639 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CTNNB1P35222 781 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 PHKA2P46019 1235 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 GPM6BQ13491 265 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TFDP1Q14186 410 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 HELQQ8TDG4 1101 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EPSTI1Q96J88 318 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CASD1Q96PB1 797 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CSRNP2Q9H175 543 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.1□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EYSQ5T1H1 3165 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 A0A0U1RQF3 1178 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 GRM6O15303 877 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 TSPAN1O60635 241 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 HIP1RO75146 1068 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ERLIN2O94905 339 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EDN1P05305 212 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 MUTP22033 750 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 BMPR1AP36894 532 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 PBX3P40426 434 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 UBA7P41226 1012 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 UBXN11Q5T124 520 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 APOL6Q9BWW8 343 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 PANK2Q9BZ23 570 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 CHST12Q9NRB3 414 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 DACT1Q9NYF0 836 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 HES2Q9Y543 173 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.09□□□□□ -0.95
LINS1-211ENST00000560941 COL4A6Q14031 1691 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CCDC169A6NNP5 214 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 H3BNC9 293 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 BMP15O95972 392 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 F13A1P00488 732 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PLA2G4BP0C869 781 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PLCG1P19174 1290 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SLC12A3P55017 1021 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PEX3P56589 373 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MCM6Q14566 821 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 HYIQ5T013 277 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ABI1Q8IZP0 508 aa9.08□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DAW1Q8N136 415 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.5 ms