RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.08■■□□□ 1.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 HES2Q9Y543 173 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PPME1Q9Y570 386 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-214ENST00000560163 PATJQ8NI35 1801 aa22.08■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 FGD1P98174 961 aa22.07■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 USP41Q3LFD5 358 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 RNF149Q8NC42 400 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CEP170P1Q96L14 293 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 VAV3Q9UKW4 847 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 ACACBO00763 2458 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 ASAP2O43150 1006 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 TSPAN1O60635 241 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 FSHRP23945 695 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 AXLP30530 894 aa22.06■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 NLRP5P59047 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP2R5CQ13362 524 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 FUT10Q6P4F1 479 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 FERMT3Q86UX7 667 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CDH7Q9ULB5 785 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 SPTLC1O15269 473 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 NR1I2O75469 434 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 PRKCQQ04759 706 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 NELL1Q92832 810 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC51Q96ER9 411 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CSRNP2Q9H175 543 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC37A4O43826 429 aa22.04■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 EVCP57679 992 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 PTENP60484 403 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 AMHR2Q16671 573 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.04■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 TGM1P22735 817 aa22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 EMC2Q15006 297 aa22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 RTP2Q5QGT7 225 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 BLIDQ8IZY5 108 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 FGF13Q92913 245 aa22.03■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 FAM170BA6NMN3 283 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB39O15060 712 aa22.02■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 RABGGTAQ92696 567 aa22.02■■□□□ 1.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 NCDNQ9UBB6 729 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 MTSS1LQ765P7 747 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 CLDN23Q96B33 292 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-214ENST00000560163 EPC1Q9H2F5 836 aa22.01■■□□□ 1.11
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