RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC66A2RUB6 948 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 H0YGN5 161 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC27A2O14975 620 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 MC3RP41968 323 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 RALBP1Q15311 655 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 PANK1Q8TE04 598 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEPSINQ96N21 525 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD209Q9NNX6 404 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.65□□□□□ -0.7
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DOCK2Q92608 1830 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLRN2A0PK11 232 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPTXRO95502 500 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASLP04424 464 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL1R1P14778 569 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE6AP16499 860 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDSP20132 328 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGFALSP35858 605 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSPNQ14714 243 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DLGAP5Q15398 846 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNA10Q16322 511 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD17CQ6PCB6 329 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH3RF2Q8TEC5 729 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 NINJ1Q92982 152 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPTNQ96CV9 577 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 B4E1Z4 1266 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNM2P50570 870 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPHA5P54756 1037 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRNDQ07001 517 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 TUSC3Q13454 348 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRY1Q16526 586 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP100Q494V2 611 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 KSR2Q6VAB6 950 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLAAQ9Y263 795 aa10.63□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDH23Q9H251 3354 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNAP23O00161 211 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMY2AP04746 511 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSF1RP07333 972 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMY2BP19961 511 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD3B2P26439 372 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00310P59036 64 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXO4P98177 505 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 VGLL4Q14135 290 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD1Q719H9 257 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSTM1Q86WC4 334 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 DTLQ9NZJ0 730 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD3Q9Y597 815 aa10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC3AQ02505 3323 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPA1O60313 960 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8BP07358 591 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIMS1P48059 325 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF460Q14592 562 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM129CQ86XR2 697 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.61□□□□□ -0.71
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms