RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.98■■□□□ 1.91
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PRKCH-216ENST00000555542 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.98■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 MIOSQ9NXC5 875 aa26.98■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC169A6NNP5 214 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 ACKR2O00590 384 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 URODP06132 367 aa26.97■■□□□ 1.91
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PRKCH-216ENST00000555542 SUSD6Q92537 303 aa26.97■■□□□ 1.91
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PRKCH-216ENST00000555542 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 S1PR5Q9H228 398 aa26.97■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.97■■□□□ 1.91
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PRKCH-216ENST00000555542 KLRC2P26717 231 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 DSC1Q08554 894 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 GRIK3Q13003 919 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 C11orf16Q9NQ32 467 aa26.96■■□□□ 1.91
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PRKCH-216ENST00000555542 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 USP20Q9Y2K6 914 aa26.96■■□□□ 1.91
PRKCH-216ENST00000555542 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.95■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.95■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 C5orf42Q9H799 3197 aa26.95■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.95■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.94■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 HIP1RO75146 1068 aa26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 EPCAMP16422 314 aa26.94■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 CABP7Q86V35 215 aa26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 PLIN2Q99541 437 aa26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.94■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 ADAM7Q9H2U9 754 aa26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.93■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.93■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 KCNK18Q7Z418 384 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 KMT5AQ9NQR1 393 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 CDH22Q9UJ99 828 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 GDAQ9Y2T3 454 aa26.92■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.91■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 PRR33A8MZF0 331 aa26.91■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.91■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.91■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 TADA2AO75478 443 aa26.9■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 MTHFRP42898 656 aa26.9■■□□□ 1.9
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PRKCH-216ENST00000555542 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 FBXL18Q96ME1 805 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 TIPINQ9BVW5 301 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 NR2E1Q9Y466 385 aa26.9■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 BMP15O95972 392 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 THP07101 528 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 ADH1AP07327 375 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 PDCP20941 246 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 CLCN4P51793 760 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 TUSC3Q13454 348 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 HYIQ5T013 277 aa26.89■■□□□ 1.9
PRKCH-216ENST00000555542 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.89■■□□□ 1.9
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