RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 APOEP02649 317 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 HMBSP08397 361 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MCM3P25205 808 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 LLGL1Q15334 1064 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TRIM11Q96F44 468 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TMEM150BA6NC51 233 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 H7C0C1 242 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 AKAP5P24588 427 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ATP5OP48047 213 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TLE2Q04725 743 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CES5AQ6NT32 575 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SHC4Q6S5L8 630 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CCDC63Q8NA47 563 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 H7C4K7 107 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 OGTO15294 1046 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TOM1L1O75674 476 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CKMP06732 381 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 NPTX2P47972 431 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 Q4G0T1 1027 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 STKLD1Q8NE28 680 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CERS4Q9HA82 394 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 RSAD1Q9HA92 442 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PDXKO00764 312 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ODC1P11926 461 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 AMHR2Q16671 573 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 IL31RAQ8NI17 732 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CEP63Q96MT8 703 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PTPN21Q16825 1174 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 GDAP1Q8TB36 358 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 HPDLQ96IR7 371 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 THAP9Q9H5L6 903 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 DNAJC18Q9H819 358 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 DONSONQ9NYP3 566 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 TBX20Q9UMR3 447 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 BUB1O43683 1085 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ITGB3P05106 788 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 LCP1P13796 627 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 CD52P31358 61 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ZNF75DP51815 510 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 UBE4BO95155 1302 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 GNA15P30679 374 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PNPLA4P41247 253 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 NME3Q13232 169 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PPP2R5CQ13362 524 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 PKN1Q16512 942 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 SNTG2Q9NY99 539 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 IRF1P10914 325 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 NFKBIAP25963 317 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 ZNF280DQ6N043 979 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP1-210ENST00000552189 RFX6Q8HWS3 928 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms