RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.02□□□□□ -0.96
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PTPRB-208ENST00000550358 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC22O60826 627 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-208ENST00000550358 SAT1P21673 171 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-208ENST00000550358 BCAR1P56945 870 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-208ENST00000550358 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-208ENST00000550358 EMC2Q15006 297 aa9.01□□□□□ -0.97
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