RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CDC42EP1Q00587 391 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 AP3B2Q13367 1082 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 USP41Q3LFD5 358 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 FUT10Q6P4F1 479 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 RABGGTAQ92696 567 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MIOSQ9NXC5 875 aa26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 WDR64B1ANS9 1081 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 C8AP07357 584 aa26.41■■□□□ 1.82
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PRDM4-202ENST00000547188 CXCL12P48061 93 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 RING1Q06587 406 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 DSC1Q08554 894 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 LIN9Q5TKA1 542 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF410Q86VK4 478 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MCRS1Q96EZ8 462 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 GAD1Q99259 594 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 DISC1Q9NRI5 854 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 LHX6Q9UPM6 363 aa26.41■■□□□ 1.82
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PRDM4-202ENST00000547188 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 AXIN1O15169 862 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
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PRDM4-202ENST00000547188 STPG1Q5TH74 334 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CASC1Q6TDU7 716 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 AKAP13Q12802 2813 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 PRC1O43663 620 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 ECI2O75521 394 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 ITGA4P13612 1032 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 MLH1P40692 756 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SCNN1GP51170 649 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 GAS6Q14393 721 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 POTEHQ6S545 545 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 CEP89Q96ST8 783 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 RNF39Q9H2S5 420 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 NBEAQ8NFP9 2946 aa26.39■■□□□ 1.82
PRDM4-202ENST00000547188 COL4A2P08572 1712 aa26.39■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 ARL5CA6NH57 179 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 MAN2B1O00754 1011 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CHMP2AO43633 222 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CYP3A4P08684 503 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 FOXC1Q12948 553 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 GRM2Q14416 872 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 PRR16Q569H4 304 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CEP68Q76N32 757 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 FANCBQ8NB91 859 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 ZFP42Q96MM3 310 aa26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.38■■□□□ 1.81
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PRDM4-202ENST00000547188 CALM1P0DP23 149 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CALM2P0DP24 149 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CALM3P0DP25 149 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 HOXC13P31276 330 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 RTP2Q5QGT7 225 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 FAM3CQ92520 227 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
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PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS3O15072 1205 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 NR1I2O75469 434 aa26.36■■□□□ 1.81
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PRDM4-202ENST00000547188 IER2Q9BTL4 223 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 BRD9Q9H8M2 597 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 HES2Q9Y543 173 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 GIPC1O14908 333 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 CNR2P34972 360 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 GPR65Q8IYL9 337 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM4-202ENST00000547188 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
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