RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 USP20Q9Y2K6 914 aa20.18■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 HES2Q9Y543 173 aa20.18■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 LPXNO60711 386 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 TOM1L1O75674 476 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 SLC34A2O95436 690 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MYL1P05976 194 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MCF2P10911 925 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 IDEP14735 1019 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 NDUFA8P51970 172 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 ADGRE1Q14246 886 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 FSIP1Q8NA03 581 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 STAMQ92783 540 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 STRA6Q9BX79 667 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 CDT1Q9H211 546 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 PANK4Q9NVE7 773 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.17■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 ASIC1P78348 528 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 COASYQ13057 564 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 LONRF3Q496Y0 759 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 RNF39Q9H2S5 420 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 HCSTQ9UBK5 93 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.16■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 ARL5CA6NH57 179 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 PPM1AP35813 382 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MLH1P40692 756 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 GRM5P41594 1212 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 MCL1Q07820 350 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 UNC13DQ70J99 1090 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 BICD1Q96G01 975 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.15■□□□□ 0.82
COPS7A-216ENST00000543170 CITO14578 2027 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 RFXAPO00287 272 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 RECQL4O94761 1208 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 AKAP5P24588 427 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 LIG4P49917 911 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 EHHADHQ08426 723 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GPM6BQ13491 265 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PAGE5Q96GU1 130 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF558Q96NG5 402 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GAD1Q99259 594 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 APOL6Q9BWW8 343 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 SNTG2Q9NY99 539 aa20.14■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 CLDN3O15551 220 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GCNT3O95395 438 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 UBE3AQ05086 875 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GRIK3Q13003 919 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PTPROQ16827 1216 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ZFP42Q96MM3 310 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PARP2Q9UGN5 583 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.13■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 ITGB1P05556 798 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 AFMP43652 599 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 SCNN1GP51170 649 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 PLCB3Q01970 1234 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 DSC1Q08554 894 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 CUL4BQ13620 913 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 KYAT1Q16773 422 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms