RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542108.1

KNOP1P1-201, Transcript of lysine rich nucleolar protein 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene KNOP1P1, Length 989 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1P1-201ENST00000542108 GPR149Q86SP6 731 aa14.66□□□□□ -0.06
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KNOP1P1-201ENST00000542108 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.62□□□□□ -0.07
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KNOP1P1-201ENST00000542108 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.62□□□□□ -0.07
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KNOP1P1-201ENST00000542108 FNIP2Q9P278 1114 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 BRD1O95696 1058 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 C8orf34Q49A92 452 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 KANK3Q6NY19 840 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P1-201ENST00000542108 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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