RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	DNM3	Q9UQ16	869 aa		9.27	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CCDC169	A6NNP5	214 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	N4BP3	O15049	544 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	WEE2	P0C1S8	567 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	EPCAM	P16422	314 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	MUT	P22033	750 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	KCNC3	Q14003	757 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	NBR1	Q14596	966 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	C8orf34	Q49A92	452 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SUSD6	Q92537	303 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	KIFAP3	Q92845	792 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	FBXL18	Q96ME1	805 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ZFP42	Q96MM3	310 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	MIOS	Q9NXC5	875 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	DPP7	Q9UHL4	492 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	IRAK3	Q9Y616	596 aa		9.26	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120		A0A1B0GUA9	196 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM221	A6NGB7	291 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120		K7ERI5	159 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120		M0R296	226 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	LAD1	O00515	517 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SOD2	P04179	222 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PRKCB	P05771	671 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ADH1A	P07327	375 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	MYB	P10242	640 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93	5e-14	■■■■■ 54.8
DDB1-208	ENST00000537120	NAMPT	P43490	491 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GLUD2	P49448	558 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93	6e-8	■■■□□ 17.2
DDB1-208	ENST00000537120	EFNA5	P52803	228 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ZXDA	P98168	799 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PTPN14	Q15678	1187 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	AMHR2	Q16671	573 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	KANK3	Q6NY19	840 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PALB2	Q86YC2	1186 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	RABGGTA	Q92696	567 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	KIF2C	Q99661	725 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TCHP	Q9BT92	498 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PIDD1	Q9HB75	910 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SNTG2	Q9NY99	539 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GDA	Q9Y2T3	454 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		9.25	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ACKR2	O00590	384 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	B4GALT3	O60512	393 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TH	P07101	528 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SPATA31D3	P0C874	917 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GJB2	P29033	226 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	MCM2	P49736	904 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	USP41	Q3LFD5	358 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CEP57	Q86XR8	500 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TMX3	Q96JJ7	454 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	FZD8	Q9H461	694 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	POMK	Q9H5K3	350 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CDH22	Q9UJ99	828 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	USP20	Q9Y2K6	914 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	MYO10	Q9HD67	2058 aa		9.24	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120		E9PMD0	336 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GLUD1	P00367	558 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CDC25A	P30304	524 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	CLCN4	P51793	760 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PEX3	P56589	373 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	GRIK3	Q13003	919 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	ECM1	Q16610	540 aa		9.23	□□□□□ -0.93
DDB1-208	ENST00000537120	PTPN21	Q16825	1174 aa		9.23	□□□□□ -0.93

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