RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523702.5

CPS1-211, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CPS1, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-211ENST00000523702 B4GALT3O60512 393 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PHF2O75151 1096 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ITGA10O75578 1167 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FPR1P21462 350 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 HTR1BP28222 390 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ECHS1P30084 290 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PER3P56645 1201 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 IL31Q6EBC2 164 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DRC7Q8IY82 874 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 OR7D4Q8NG98 312 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NT5C1BQ96P26 610 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 BCO1Q9HAY6 547 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NUAK1O60285 661 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NOBOXO60393 691 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RHCEP18577 417 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PCSK1P29120 753 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ATP8B2P98198 1209 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RHDQ02161 417 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 UBE4AQ14139 1066 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TTC7BQ86TV6 843 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PJA1Q8NG27 643 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MDM1Q8TC05 714 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ZNF480Q8WV37 535 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TDP1Q9NUW8 608 aa7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ARHGAP6O43182 974 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DTNBO60941 627 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ENDOD1O94919 500 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RHBDL3P58872 404 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CDC42EP1Q00587 391 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SNAPC2Q13487 334 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SYT8Q8NBV8 401 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 IFI44Q8TCB0 444 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RGMAQ96B86 450 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PTPN18Q99952 460 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ARMT1Q9H993 441 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NCDNQ9UBB6 729 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 L1RE1Q9UN81 338 aa7.11□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 GUCY1A2P33402 732 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PTPN7P35236 360 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NEK3P51956 506 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 HK3P52790 923 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NFYCQ13952 458 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PMM1Q92871 262 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CEP95Q96GE4 821 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TMX3Q96JJ7 454 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NR2E1Q9Y466 385 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.1□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SGTAO43765 313 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 STC2O76061 302 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ZBED1O96006 694 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DDCP20711 480 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CRHR1P34998 444 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 WNT3AP56704 352 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DUSP2Q05923 314 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NOGQ13253 232 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.09□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 KRT40Q6A162 431 aa7.09□□□□□ -1.27
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