RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 PSMD10O75832 226 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 BMP15O95972 392 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 IGHA1P01876 353 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CTSBP07858 339 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CELA3AP09093 270 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ARP10275 920 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 AKR1A1P14550 325 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PTGS1P23219 599 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 HOXD10P28358 340 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PRPHP41219 470 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 USP11P51784 963 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGAP1Q07960 439 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 RBL2Q08999 1139 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ACVR2BQ13705 512 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DOC2BQ14184 412 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PRR16Q569H4 304 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ATL3Q6DD88 541 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MCTP1Q6DN14 999 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 FDX2Q6P4F2 183 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 METTL7BQ6UX53 244 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TLK2Q86UE8 772 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM130Q8N3G9 435 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 RAET1EQ8TD07 263 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SCFD2Q8WU76 684 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 HAS1Q92839 578 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SLC5A5Q92911 643 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CDHR1Q96JP9 859 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MTMR9Q96QG7 549 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 RNF208Q9H0X6 261 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CAPN10Q9HC96 672 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 RAD18Q9NS91 495 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TLDC2A0PJX2 215 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MYADML2A6NDP7 307 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 B4DLN1 442 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ENC1O14682 589 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CTAGE5O15320 804 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MSCO60682 206 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ATP9AO75110 1047 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PAGE1O75459 146 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 GGPS1O95749 300 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DLGAP3O95886 979 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CCNE2O96020 404 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 F2P00734 622 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MMP3P08254 477 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CTSHP09668 335 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TGFB3P10600 412 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 NME2P22392 152 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MCM7P33993 719 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 KRT85P78386 507 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 SP2Q02086 613 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 GRIN1Q05586 938 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 PPP2R5CQ13362 524 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TTLL4Q14679 1199 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CALCRLQ16602 461 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ANO1Q5XXA6 986 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-212ENST00000498694 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.54□□□□□ -1.68
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