RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	VPS16	Q9H269	839 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP1R37	O75864	691 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	CXCL10	P02778	98 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	LGALS2	P05162	132 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	MMP3	P08254	477 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	CKB	P12277	381 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	IL9	P15248	144 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	ARL2	P36404	184 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	NPTX2	P47972	431 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	DNM2	P50570	870 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25	4e-8	■□□□□ 10.2
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC16A4	O15374	487 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	MAGEB2	O15479	319 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	NBN	O60934	754 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	NR2F2	P24468	414 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	MARK3	P27448	753 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXD13	P35453	343 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	UBXN1	Q04323	297 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	RBL2	Q08999	1139 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	GPNMB	Q14956	572 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CIZ1-223	ENST00000491954	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.46	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954		H3BRB1	525 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	ASAP2	O43150	1006 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TEX33	O43247	280 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	DCX	O43602	365 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	NRDC	O43847	1150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	NR3C1	P04150	777 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TPM1	P09493	284 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNA1	Q09470	495 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNN1	Q92952	543 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	COL1A2	P08123	1366 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQC6	194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	CLIC2	O15247	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	AMH	P03971	560 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	NAMPT	P43490	491 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	STRN3	Q13033	797 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	PTK7	Q13308	1070 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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