RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489838.5

WDR48-210, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 3

Gene WDR48, Length 360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-210ENST00000489838 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.74□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 KLHL33A6NCF5 533 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 CYR61O00622 381 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ACRV1P26436 265 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ECHS1P30084 290 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 MCAMP43121 646 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 IGBP1P78318 339 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 CRHR2Q13324 411 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 MB21D1Q8N884 522 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ST8SIA2Q92186 375 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.73□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PER3P56645 1201 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PPP3CAQ08209 521 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 NOMO1Q15155 1222 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PTPN21Q16825 1174 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 FAM83AQ86UY5 434 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 PPM1NQ8N819 430 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 MDM1Q8TC05 714 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 JADE3Q92613 823 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 BCO1Q9HAY6 547 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 DNM3Q9UQ16 869 aa6.72□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 ZMYM3Q14202 1370 aa6.71□□□□□ -1.33
WDR48-210ENST00000489838 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PTPN7P35236 360 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 GDF5P43026 501 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 KRT85P78386 507 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 NRN1LQ496H8 165 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 Q6ZVL8 140 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 OR7D4Q8NG98 312 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 GPR87Q9BY21 358 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 VPS11Q9H270 941 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 TNKSO95271 1327 aa6.71□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 ADCY6O43306 1168 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA12O60330 932 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 NDUFS2O75306 463 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 ENDOD1O94919 500 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 CCND1P24385 295 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 MAN2A2P49641 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 MGAT2Q10469 447 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 Q6ZRM9 215 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 DOK3Q7L591 496 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 EXTL1Q92935 676 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.7□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 B5MCH6 92 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 FZD9O00144 591 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 FZD7O75084 574 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 HK1P19367 917 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 SCNN1GP51170 649 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 HMGA2P52926 109 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 RABGGTBP53611 331 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 SLC16A1P53985 500 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 XYLT1Q86Y38 959 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 REPS2Q8NFH8 660 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 PGBD4Q96DM1 585 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 MNTQ99583 582 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 MRIQ9BWK5 157 aa6.69□□□□□ -1.34
WDR48-210ENST00000489838 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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