RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC27Q9C0I9 530 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM59LQ9UK28 342 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIA2O75334 1257 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EPHB2P29323 1055 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NT5C2P49902 561 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CUL3Q13618 768 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 UCMAQ8WVF2 138 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 WDR91A4D1P6 747 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CBX6O95503 412 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC3Q13217 504 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PODNQ7Z5L7 613 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CENPTQ96BT3 561 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 BMP3P12645 472 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CASP4P49662 377 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 BNIP1Q12981 228 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM7Q9H2U9 754 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CLSTN1O94985 981 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 STAT1P42224 750 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RPL21P46778 160 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NOVP48745 357 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17.35■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TNFAIP3P21580 790 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 AUHQ13825 339 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CNKSR1Q969H4 720 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EML1O00423 815 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 THAP12O43422 761 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FESP07332 822 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 KYNUQ16719 465 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NT5DC3Q86UY8 548 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PGM2Q96G03 612 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CALB2P22676 271 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB16Q05516 673 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DACT2Q5SW24 774 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DYDC2Q96IM9 177 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GCNT4Q9P109 453 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DCTN4Q9UJW0 460 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa17.34■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MSH4O15457 936 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SPOPO43791 374 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 POLD1P28340 1107 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH3A1P30838 453 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MFN1Q8IWA4 741 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 EPAS1Q99814 870 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.33■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KCNA3P22001 575 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CNGA1P29973 690 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMED2Q15363 201 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MYCT1Q8N699 235 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ERMNQ8TAM6 284 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SMCHD1A6NHR9 2005 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PEX5P50542 639 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SYCP3Q8IZU3 236 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TEX9Q8N6V9 391 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIBP2Q8ND30 876 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms