RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	NINJ1	Q92982	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	TGM5	O43548	720 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	BMPR1A	P36894	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ADAM2	Q99965	735 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	SPDEF	O95238	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCNL1-223	ENST00000481173	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	CDC45	O75419	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	C1R	P00736	705 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	CD40	P25942	277 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SCNN1B	P51168	640 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	LRRC32	Q14392	662 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	NELL1	Q92832	810 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	POGK	Q9P215	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ESRRB	O95718	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ITGAM	P11215	1152 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ITGB6	P18564	788 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	APBA1	Q02410	837 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MGAT5	Q09328	741 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	REST	Q13127	1097 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1W2PR48	441 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	PRSS38	A1L453	326 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	PFKM	P08237	780 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MPL	P40238	635 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	IL2	P60568	153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MPP3	Q13368	585 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	NEU1	Q99519	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	FEZ1	Q99689	392 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	FKBP9	O95302	570 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	MATN4	O95460	622 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCNL1-223	ENST00000481173	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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