RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 MFSD10Q14728 455 aa17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 LMO3Q8TAP4 145 aa17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa17.77■□□□□ 0.44
USP20-204ENST00000472108 KAT6AQ92794 2004 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MYL3P08590 195 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PSEN2P49810 448 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 FAM187BQ17R55 369 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 EPC2Q52LR7 807 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.77■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 YY1P25490 414 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MXI1P50539 228 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 GJA9P57773 515 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CLDN10P78369 228 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PSMD6Q15008 389 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 HGSNATQ68CP4 663 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KRT39Q6A163 491 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KIF18AQ8NI77 898 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CCDC42Q96M95 316 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MINDY3Q9H8M7 445 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.76■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 A0A087WZ62 844 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KPNA6O60684 536 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 VTNP04004 478 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PROZP22891 400 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 HOXD10P28358 340 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ACOT2P49753 483 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 VEGFBP49765 207 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 JAM2P57087 298 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CHMP4BP1P59074 171 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MCL1Q07820 350 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 IQCEQ6IPM2 695 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SPAG5Q96R06 1193 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 TCHPQ9BT92 498 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KATNAL1Q9BW62 490 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PTPRHQ9HD43 1115 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ABLIM1O14639 778 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SEPT4O43236 478 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SERPING1P05155 500 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 IQCF3P0C7M6 154 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 RFX1P22670 979 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 PURAQ00577 322 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CDC42EP1Q00587 391 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 STK33Q9BYT3 514 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SRRDQ9UH36 339 aa17.75■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ZEB2O60315 1214 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 FAM189A1O60320 539 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 DLATP10515 647 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 GPC3P51654 580 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 NKX3-2P78367 333 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 KRT83P78385 493 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ADAM17P78536 824 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 GJB7Q6PEY0 223 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 MPZL3Q6UWV2 235 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 ZNF410Q86VK4 478 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 FNBP1Q96RU3 617 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.73■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa17.73■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 OGTO15294 1046 aa17.73■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
USP20-204ENST00000472108 TRIM32Q13049 653 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms