RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 INPPL1O15357 1258 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 SOD2P04179 222 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MUTP22033 750 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MAPK6Q16659 721 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 IFT74Q96LB3 600 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 NR2E1Q9Y466 385 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 WDFY4Q6ZS81 3184 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TECTAO75443 2155 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 F8W810 466 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PRKCBP05771 671 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MTHFRP42898 656 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 NAMPTP43490 491 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ZXDAP98168 799 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 DSC1Q08554 894 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PPP2R5AQ15172 486 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 FBXL18Q96ME1 805 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 FZD8Q9H461 694 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 USP20Q9Y2K6 914 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 N4BP3O15049 544 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 GLUD2P49448 558 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PDIA5Q14554 519 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 KRT79Q5XKE5 535 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TRIM67Q6ZTA4 783 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 RABGGTAQ92696 567 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TMX3Q96JJ7 454 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 STK24Q9Y6E0 443 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TMEM221A6NGB7 291 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PP2D1A8MPX8 630 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 H3BQV1 296 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 M0R296 226 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CLCN4P51793 760 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 GRIK3Q13003 919 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 FAM187BQ17R55 369 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 SFXN1Q9H9B4 322 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 SNTG2Q9NY99 539 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MUC6Q6W4X9 2439 aa24.04■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 LAD1O00515 517 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 GJB2P29033 226 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CDC25AP30304 524 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PTPN21Q16825 1174 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 KIFAP3Q92845 792 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 DNM3Q9UQ16 869 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 E9PMD0 336 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ACKR2O00590 384 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 LILRB3O75022 631 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 ADH1AP07327 375 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 MYBP10242 640 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 B3GALT6Q96L58 329 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.02■■□□□ 1.44
TTC28-204ENST00000468807 CCDC169A6NNP5 214 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 TEX28O15482 410 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 TADA2AO75478 443 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 EDN1P05305 212 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 EFNA5P52803 228 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 IL17AQ16552 155 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 FUT10Q6P4F1 479 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 GDAQ9Y2T3 454 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.01■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 PLXNA3P51805 1871 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 CASTOR2A6NHX0 329 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 RECQL4O94761 1208 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 PRPHP41219 470 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 EEF1DP3Q658K8 133 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 HASPINQ8TF76 798 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 GPR62Q9BZJ7 368 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 MAN1C1Q9NR34 630 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 MYO10Q9HD67 2058 aa23.99■■□□□ 1.43
TTC28-204ENST00000468807 GLUD1P00367 558 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms