RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453944.1

DDX59-208, Transcript of DEAD-box helicase 59, human

TSL 3

Gene DDX59, Length 643 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX59-208	ENST00000453944	ADAM15	Q13444	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	FGL2	Q14314	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PHKB	Q93100	1093 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	MGEA5	O60502	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	NBN	O60934	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TYR	P14679	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PFKL	P17858	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	MAL	P21145	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ECHS1	P30084	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SREBF1	P36956	1147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	LRP8	Q14114	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	APIP	Q96GX9	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SLC16A6	O15403	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	DAPK3	O43293	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PAPLN	O95428	1278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	FPR1	P21462	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TNFSF4	P23510	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	HAL	P42357	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CASP5	P51878	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	FMO1	Q01740	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TRIM14	Q14142	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	RASA4B	C9J798	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944		F8W8V4	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	RASA4	O43374	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	SGTA	O43765	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PEX10	O60683	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	ADAM23	O75077	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	PHF2	O75151	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDX59-208	ENST00000453944	KLHL18	O94889	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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