RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 CLDN3O15551 220 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ZEB2O60315 1214 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 KPNA6O60684 536 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ACLYP53396 1101 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNN1Q92952 543 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXL18Q96ME1 805 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 GSDMDP57764 484 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF180Q86T96 592 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM192Q8IY95 271 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 NOL4O94818 638 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ZMYND15Q9H091 742 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 MFAP3LO75121 409 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TOM1L1O75674 476 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 SKILP12757 684 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT13P13646 458 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 FMO5P49326 533 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP24A1Q07973 514 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 24.2
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT9P35527 623 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 GJB7Q6PEY0 223 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ZPBP2Q6X784 338 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 EXTL3O43909 919 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM189A1O60320 539 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 CTSHP09668 335 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PRMT2P55345 433 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM139Q8IV31 216 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PON1P27169 355 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCD1P33897 745 aa22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP2-204ENST00000452765 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP2-204ENST00000452765 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 GCNT4Q9P109 453 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF233A6NK53 670 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPAN1O60635 241 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 POU5F1BQ06416 359 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM212AQ96EL1 285 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB118Q96PH6 123 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 GNAT1P11488 350 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PROZP22891 400 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF516Q92618 1163 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 CDT1Q9H211 546 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 DYNC1I1O14576 645 aa22.71■■□□□ 1.23
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF410Q86VK4 478 aa22.71■■□□□ 1.23
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SH3BP2-204ENST00000452765 PTGISQ16647 500 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 NEK11Q8NG66 645 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-204ENST00000452765 ERLIN2O94905 339 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 SCP2P22307 547 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL7Q01449 175 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX17Q15036 470 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF208Q9H0X6 261 aa22.7■■□□□ 1.22
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