RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 NPAS4Q8IUM7 802 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 STRA6Q9BX79 667 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF623O75123 536 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R37O75864 691 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SMC2O95347 1197 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GCNT3O95395 438 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EOMESO95936 686 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-21P61565 698 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN11Q5T124 520 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZPBP2Q6X784 338 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TFF2Q03403 129 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNB1Q14721 858 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PGBD4Q96DM1 585 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 BICD1Q96G01 975 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ACCSQ96QU6 501 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01553A4QN01 128 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 UPP2O95045 317 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGRP01833 764 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EDN1P05305 212 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBP10242 640 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PTMSP20962 102 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PNOCQ13519 176 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRED2Q7Z698 418 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HACE1Q8IYU2 909 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HPS3Q969F9 1004 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GSDMAQ96QA5 445 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM206Q9H813 350 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RMND1Q9NWS8 449 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 USP20Q9Y2K6 914 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC28Q96AY4 2481 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC3P53804 2025 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXA2O43364 376 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TOM1L1O75674 476 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RHOBTB3O94955 611 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 NPTXRO95502 500 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LIG4P49917 911 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP5P51878 434 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SMARCE1Q969G3 411 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TCHPQ9BT92 498 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 INSL6Q9Y581 213 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 VCANP13611 3396 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PROZP22891 400 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNQ1P51787 676 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HLA-CQ95604 372 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE4BO95155 1302 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 COL4A6Q14031 1691 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 DGKIO75912 1065 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms