RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439120.1

AC004540.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC004540.1, Length 891 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004540.1-201ENST00000439120 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 IFT74Q96LB3 600 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 FBXL18Q96ME1 805 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
AC004540.1-201ENST00000439120 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 N4BP3O15049 544 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 NAMPTP43490 491 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 GLUD2P49448 558 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DSC1Q08554 894 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 GRIK3Q13003 919 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 MARCH5Q9NX47 278 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 MIOSQ9NXC5 875 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KLK14Q9P0G3 267 aa20.39■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PRKCBP05771 671 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ADH1AP07327 375 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CLCN4P51793 760 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PTGDRQ13258 359 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 FAM187BQ17R55 369 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 MCTP1Q6DN14 999 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KANK3Q6NY19 840 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KCNH6Q9H252 994 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 FZD8Q9H461 694 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DPP7Q9UHL4 492 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.38■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 LAD1O00515 517 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PDIA5Q14554 519 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 BSNDQ8WZ55 320 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KIFAP3Q92845 792 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.37■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TRIOO75962 3097 aa20.36■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 EFNA5P52803 228 aa20.36■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KRT79Q5XKE5 535 aa20.36■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.36■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.36■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 F8W810 466 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ACKR2O00590 384 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TEX28O15482 410 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 LILRB3O75022 631 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TADA2AO75478 443 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 GLUD1P00367 558 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 MTMR3Q13615 1198 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ECM1Q16610 540 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 FUT10Q6P4F1 479 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 GPR149Q86SP6 731 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SNTG2Q9NY99 539 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DNM3Q9UQ16 869 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TECTAO75443 2155 aa20.35■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 H3BQV1 296 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DSG1Q02413 1049 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TUSC3Q13454 348 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 USP41Q3LFD5 358 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 FBXL6Q8N531 539 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 POLD4Q9HCU8 107 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 USTQ9Y2C2 406 aa20.34■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CCDC169A6NNP5 214 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 RECQL4O94761 1208 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 THP07101 528 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 PRPHP41219 470 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 CREMQ03060 361 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.33■□□□□ 0.85
AC004540.1-201ENST00000439120 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms