RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.77■□□□□ 0.28
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HERC3-206ENST00000431413 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 GLUD2P49448 558 aa16.76■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 IFT74Q96LB3 600 aa16.76■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 ADPGKQ9BRR6 497 aa16.76■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.76■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 C2CD2LO14523 706 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 AKAP5P24588 427 aa16.75■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 PRRX2Q99811 253 aa16.74■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.73■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.73■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 DNM3Q9UQ16 869 aa16.73■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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HERC3-206ENST00000431413 BSNDQ8WZ55 320 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 CHST7Q9NS84 486 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 TECTAO75443 2155 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-206ENST00000431413 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 103.4
HERC3-206ENST00000431413 EFEMP2O95967 443 aa16.71■□□□□ 0.27
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