RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ACP6Q9NPH0 428 aa20.1■□□□□ 0.81
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SH3BP1-202ENST00000417536 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 COMTP21964 271 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC27Q6P3X3 843 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.09■□□□□ 0.81
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SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf60A6NFR6 353 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-202ENST00000417536 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.08■□□□□ 0.81
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SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PFASO15067 1338 aa20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1-202ENST00000417536 HMGCS2P54868 508 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNB2P17787 502 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ1P48048 391 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.06■□□□□ 0.8
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