RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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SPRN-201ENST00000414069 GDF3Q9NR23 364 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 CDR1P51861 262 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 CETN1Q12798 172 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 PPFIA1Q13136 1202 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 NNTQ13423 1086 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 TNFAIP1Q13829 316 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPRN-201ENST00000414069 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPRN-201ENST00000414069 LPAR1Q92633 364 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 SMIM23A6NLE4 172 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 ACOT2P49753 483 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 ITIH3Q06033 890 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPRN-201ENST00000414069 TMEM206Q9H813 350 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPRN-201ENST00000414069 TBX20Q9UMR3 447 aa22.39■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.39■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 STRA6Q9BX79 667 aa22.39■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.39■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 RGS20O76081 388 aa22.38■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 BACE1P56817 501 aa22.38■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 GUCY1A3Q02108 690 aa22.37■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 KCND2Q9NZV8 630 aa22.37■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.36■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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SPRN-201ENST00000414069 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.35■■□□□ 1.17
SPRN-201ENST00000414069 NEK9Q8TD19 979 aa22.35■■□□□ 1.17
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