RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409125.8

GPD2-202, Transcript of glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPD2, Length 2,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2-202ENST00000409125 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MXD3Q9BW11 206 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GALNT8Q9NY28 637 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.51□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CFAP69A5D8W1 941 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MYMKA6NI61 221 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MAP3K7O43318 606 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PRKAB2O43741 272 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ATP9AO75110 1047 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MUTP22033 750 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PSMD7P51665 324 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NEK2P51955 445 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MOGSQ13724 837 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PFASO15067 1338 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CETN3O15182 167 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TGFB3P10600 412 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GM2AP17900 193 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TAC1P20366 129 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 OXCT1P55809 520 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CBX3Q13185 183 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ITGA9Q13797 1035 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RASGRF1Q13972 1273 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GIT2Q14161 759 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RAD54LQ92698 747 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SYNCQ9H7C4 482 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PPCSQ9HAB8 311 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 BARHL2Q9NY43 387 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.5□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TRAF5O00463 557 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CCDC22O60826 627 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 UCHL3P15374 230 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MAN1A1P33908 653 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 JAM2P57087 298 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 GRB10Q13322 594 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RELL1Q8IUW5 271 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ERP27Q96DN0 273 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CCDC77Q9BR77 488 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SENP1Q9P0U3 644 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SNX24Q9Y343 169 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 MAP3K13O43283 966 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CDH16O75309 829 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 BRAFP15056 766 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CALCOCO2Q13137 446 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CCDC174Q6PII3 467 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 CHKBQ9Y259 395 aa9.49□□□□□ -0.89
GPD2-202ENST00000409125 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms