RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 VPS36Q86VN1 386 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 SLC30A5Q8TAD4 765 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 TAS1R2Q8TE23 839 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA1Q92805 767 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 MAML3Q96JK9 1138 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1586Q9HCI6 787 aa19.37■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 SEZ6Q53EL9 994 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 PPM1KQ8N3J5 372 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 PDE11AQ9HCR9 933 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-201ENST00000331789 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.34■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 ENPEPQ07075 957 aa19.34■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 PPTC7Q8NI37 304 aa19.34■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.34■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.34■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 CTAGE4Q8IX94 777 aa19.33■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 TINF2Q9BSI4 451 aa19.33■□□□□ 0.69
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ACTB-201ENST00000331789 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 C22orf31O95567 290 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 LDHAP00338 332 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 PRKCBP05771 671 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 H2AFZP0C0S5 128 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 TNNI1P19237 187 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 MFAP3P55082 362 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-201ENST00000331789 CHADLQ6NUI6 762 aa19.33■□□□□ 0.68
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