RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 ISM2Q6H9L7 571 aa24.97■■□□□ 1.59
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM206Q9H813 350 aa24.97■■□□□ 1.59
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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SIGMAR1-201ENST00000277010 MYOGP15173 224 aa24.97■■□□□ 1.59
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.94■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 HELQQ8TDG4 1101 aa24.94■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ABI1Q8IZP0 508 aa24.94■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 GBP3Q9H0R5 595 aa24.94■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PARP2Q9UGN5 583 aa24.94■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TGFB1I1O43294 461 aa24.93■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 KLK14Q9P0G3 267 aa24.93■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 RECQL4O94761 1208 aa24.92■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 COL4A6Q14031 1691 aa24.91■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.91■■□□□ 1.58
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SIGMAR1-201ENST00000277010 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.91■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARL5CA6NH57 179 aa24.9■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARHGEF15O94989 841 aa24.9■■□□□ 1.58
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIF20AO95235 890 aa24.9■■□□□ 1.58
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