RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113889.8

Gtf3c5-202, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Otud5Q3U2S4 566 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Skap1Q3UUV5 355 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gngt1Q61012 74 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Trpv1Q704Y3 839 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Calhm6Q8C9E8 313 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pcdha2Q91Y17 948 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fgd4Q91ZT5 766 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zfp623Q9CY99 499 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tmod4Q9JLH8 345 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm6121L7MUF1 212 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Palb2Q3U0P1 1104 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tcaf1Q8BNE1 924 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lca5lQ8C0X0 741 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tspan8Q8R3G9 235 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ttc1Q91Z38 292 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tsnaxip1Q99P25 704 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fam173bQ9D1Z3 247 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 PorcnQ9JJJ7 461 aa14.66□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Trim30cD3YVI9 513 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc24E9PUW8 296 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm4841E9QAA8 417 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Usp4P35123 962 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Serpina1eQ00898 413 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Nr1d1Q3UV55 615 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 FktnQ8R507 461 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 BbxQ8VBW5 907 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Olfr1499Q8VG65 314 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 H2-OaQ9QWV1 250 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Golga5Q9QYE6 729 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Grk1Q9WVL4 564 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Kank3Q9Z1P7 791 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Wee1P47810 646 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cdc25cP48967 447 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Kcnj4P52189 445 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ly9Q01965 654 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rnf139Q7TMV1 668 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rufy1Q8BIJ7 712 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fam177a1Q8BR63 207 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Commd10Q8JZY2 202 aa14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dhtkd1A2ATU0 921 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Wdr72D3YYM4 1114 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 DeptorQ570Y9 409 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 EsrrbQ61539 433 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sema5aQ62217 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ppm1eQ80TL0 749 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mapk15Q80Y86 549 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tor4aQ8BH02 426 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 GopcQ8BH60 463 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Alg1Q921Q3 482 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mis12Q9CY25 206 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lman1Q9D0F3 517 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fam114a1Q9D281 569 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gap43P06837 227 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Vgll3P85442 326 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 HelqQ2VPA6 1069 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc181Q80ZU5 509 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Smc6Q924W5 1097 aa14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rrm1P07742 792 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cbx2P30658 519 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 TxkP42682 527 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Bbof1Q3V079 533 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sco1Q5SUC9 284 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ttyh3Q6P5F7 524 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Stoml1Q8CI66 399 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cpa5Q8R4H4 436 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gdap1O88741 358 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Srebf2Q3U1N2 1130 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Adamts18Q4VC17 1219 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tll1Q62381 1013 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pde1cQ64338 706 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Plppr4Q7TME0 766 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Q8BGD0 127 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tlr3Q99MB1 905 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Usp26Q99MX1 835 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Arih1Q9Z1K5 555 aa14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 PtenO08586 403 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pex5O09012 639 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lta4hP24527 611 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Surf6P70279 355 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rmdn3Q3UJU9 470 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.3 ms