RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tor4aQ8BH02 426 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efl1Q8C0D5 1127 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rtp1Q8C8C1 263 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm4758L7N258 96 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wnt7bP28047 349 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shox2P70390 331 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eepd1Q3TGW2 569 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Palb2Q3U0P1 1104 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vps41Q5KU39 853 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npdc1Q64322 332 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Enoph1Q8BGB7 257 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfml3Q8BK62 406 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 C130026I21RikQ8C898 291 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Calcoco1Q8CGU1 691 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slf1Q8R3P9 1054 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nudt12Q9DCN1 462 aa23.68■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf804aA2AKY4 1200 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irf8P23611 424 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtus1Q5HZI1 1210 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fsd1lQ8BYN5 507 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CgasQ8C6L5 507 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm4bQ91VY5 1086 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdca7Q9D0M2 382 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mta2Q9R190 668 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RptorQ8K4Q0 1335 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GabpaQ00422 454 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 StilQ60988 1262 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim37Q6PCX9 961 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem161bQ8C2L6 487 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Apol9bQ8C7I4 310 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhl11Q8CE33 709 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Apol9aQ8VDU3 310 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tti1Q91V83 1085 aa23.67■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TazI7HJS2 263 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Msh2P43247 935 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lgr6Q3UVD5 967 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sema5aQ62217 1077 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpd2Q64521 727 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpa5Q8R4H4 436 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fkbp6Q91XW8 327 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bpifb9bA2AJD1 591 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc1a1P51906 523 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fdxacb1Q3UY23 622 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc125Q5U465 500 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bpifb9aQ80XI7 591 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptrh1Q8BW00 204 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc169Q8BXX9 214 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnma1Q8C1C8 353 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem120aQ8C1E7 343 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tgm5Q9D7I9 724 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cnot8Q9D8X5 292 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IdeQ9JHR7 1019 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fem1bQ9Z2G0 627 aa23.66■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rps6P62754 249 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sox10Q04888 466 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mipol1Q9D9F8 279 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf6Q9DBU5 667 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tacc3Q9JJ11 631 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taf1Q80UV9 1891 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DgkhD3YXJ0 1156 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alkbh1P0CB42 389 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RxrbP28704 520 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc25cP48967 447 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo6Q64331 1265 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp3a11Q64459 504 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ntrk3Q6VNS1 825 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmynd10Q99ML0 440 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sapcd2Q9D818 391 aa23.65■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21973F6WEZ7 68 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abl2Q4JIM5 1182 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb17Q60821 794 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tarsl2Q8BLY2 790 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrameQ9D4Z5 464 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v1e2Q9D593 226 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Capn15Q9JLG8 1095 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klrc2Q9WTJ9 238 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb6cW4VSP4 379 aa23.64■■□□□ 1.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp457L7N1X4 647 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SpoplQ2M2N2 392 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm2163Q6PCY5 473 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Actl9Q8CG27 415 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mill1Q8HWE7 395 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcur1Q9CXD6 340 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irx5Q9JKQ4 484 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ggt5Q9Z2A9 573 aa23.64■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krt12Q64291 487 aa23.63■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Daam2Q80U19 1115 aa23.63■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nipa1Q8BHK1 323 aa23.63■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa23.63■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rint1Q8BZ36 792 aa23.63■■□□□ 1.37
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spire2Q8K1S6 718 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms