RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B BUL1P48524 976 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NAS6P50086 228 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B UBC9P50623 157 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YIP1P53039 248 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CLD1P53264 445 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B BTN2P53286 410 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B DBP6P53734 629 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL13Q02204 264 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B DIG1Q03063 452 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO20Q04359 397 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B STE23Q06010 1027 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RRG8Q06109 277 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SYT1Q06836 1226 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PSK2Q08217 1101 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B AFT2Q08957 416 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG6Q12001 544 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B GET4Q12125 312 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR126CQ12288 251 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS13P05756 151 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SIR2P06700 562 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD7P06779 565 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL30P14120 105 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ATP10P18496 279 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B TOD6P34219 525 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B UPS2P35200 230 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL063CP35725 167 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YKR078WP36158 585 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SKG1P36169 355 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B POP4P38336 279 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B EFM2P38347 419 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CHL4P38907 458 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CKB2P38930 258 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CAJ1P39101 391 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM2P39721 246 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PHM8P40025 321 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B LAS21P40367 830 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC28P40509 296 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPS18P42847 217 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B GON7P46984 123 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data0.42□□□□□ -2.34not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CAX4P53223 239 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SHY1P53266 389 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR151CP53287 111 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B IST1P53843 298 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RNH201P53942 307 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B DIA1P54005 336 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ERV25P54837 211 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YML122CQ03207 126 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B GOT1Q03554 138 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RSM24Q03976 319 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B UPS1Q05776 175 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC123Q05791 360 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NNT1Q05874 261 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR098CQ06089 161 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SLD7Q08457 257 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B VAM10Q08474 114 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL264CQ08980 353 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RLM1Q12224 676 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR214CQ12282 236 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CRC1Q12289 327 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B JID1Q12350 301 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B HMS1Q12398 434 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RRI1Q12468 440 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RGS2Q99188 309 aa0.42□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B STE2D6VTK4 431 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SOD2P00447 233 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC28P00546 298 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SPS4P09937 338 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ERR1P0CX10 437 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ERR2P0CX11 437 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC23P16522 626 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B EXO70P19658 623 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ATP12P22135 325 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CTR86P25355 563 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B DEP1P31385 405 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NGG1P32494 702 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MRE11P32829 692 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SSO1P32867 290 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B STO1P34160 861 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MCH2P36032 473 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YKR015CP36111 568 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B BMT2P38278 337 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RTC2P38279 296 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B HIS2P38635 335 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX7P39108 375 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B IRC22P40006 225 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ISC1P40015 477 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RRT13P40042 185 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B COX15P40086 486 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL194CP40169 301 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B OST1P41543 476 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PSA1P41940 361 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ERR3P42222 437 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B HXT14P42833 540 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG25P53045 309 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B BOL2P53082 120 aa0.41□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RMD9P53140 646 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73 ms