RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	GON7	P46984	123 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YJL016W	P47072	561 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	UBC13	P52490	153 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	STE23	Q06010	1027 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YDR262W	Q12331	272 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	FRE6	Q12473	712 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	SKS1	Q12505	502 aa		0.26	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	CDC7	P06243	507 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	KRE6	P32486	720 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	COT1	P32798	439 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	DAD2	P36162	133 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	KRE29	P40026	464 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	RPE1	P46969	238 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	IRC4	Q03036	179 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	LOA1	Q06508	300 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.25	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	AEP1	P32493	518 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	ZRT1	P32804	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	POP8	P38208	133 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YHL026C	P38740	315 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YHR035W	P38769	630 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	PES4	P39684	611 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	GLE2	P40066	365 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YER135C	P40082	130 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	GDS1	P41913	522 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	NUP57	P48837	541 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YGL114W	P53134	725 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YGR168C	P53293	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	OKP1	P53298	406 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YNL146W	P53906	100 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	NUP49	Q02199	472 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	ECM18	Q04623	453 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	INM2	Q05533	292 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	BUR2	Q05949	395 aa		0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	COS2	P0CX12	379 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	COS3	P0CX13	379 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	IFM1	P25038	676 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.23	□□□□□ -2.37	not detected
BLI1	YKL061W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	RXT2	P38255	430 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	ARN2	P38724	620 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	SEN34	P39707	275 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	INA22	P40576	216 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.23	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	SGA1	P08019	549 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	PPH21	P23594	369 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	CSG2	P35206	410 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	PHO89	P38361	574 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	JEM1	P40358	645 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	MDM34	P53083	459 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YGR016W	P53209	190 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	EOS1	P53938	366 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	NFI1	Q12216	726 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.22	□□□□□ -2.37
BLI1	YKL061W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	ERG2	P32352	222 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SCM4	P32564	187 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YKR045C	P36138	183 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	HMT1	P38074	348 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SIF2	P38262	535 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DSE2	P38844	325 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	FET3	P38993	636 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CAJ1	P39101	391 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PEP8	P40335	379 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YJL118W	P47022	219 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	KEL2	P50090	882 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	COG7	P53195	279 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	AAH1	P53909	347 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DPP1	Q05521	289 aa		0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	GEP5	Q12393	293 aa		0.21	□□□□□ -2.38

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