RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C VMR1P38735 1592 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SIR4P11978 1358 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C DAL81P21657 970 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SUR1P33300 382 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C CSE1P33307 960 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C MED8P38304 223 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C INA22P40576 216 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YFL040WP43562 540 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C STE23Q06010 1027 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C VIK1Q12045 647 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ERP3Q12403 225 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SWI1P09547 1314 aa1.91□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C LYS2P07702 1392 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPS1P32329 569 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ZRT1P32804 376 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TKL2P33315 681 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SDH4P37298 181 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YHR035WP38769 630 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SPT8P38915 602 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CAJ1P39101 391 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RIO2P40160 425 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C UTP25P40498 721 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPL080CQ02826 108 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SEC13Q04491 297 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YDR286CQ05530 114 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RLP24Q07915 199 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YOR292CQ08743 309 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C IES3Q12345 250 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YSP2Q06681 1438 aa1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PPQ1P32945 549 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PRX1P34227 261 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C HYR1P40581 163 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ECO1P43605 281 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YFR045WP43617 309 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YGL088WP53151 121 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPL113CQ02961 396 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SPO19Q03029 223 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SNX41Q04053 625 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YDR114CQ04597 100 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SML1Q04964 104 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C DXO1Q06349 442 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PGC1Q08959 321 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YKL068W-AQ3E826 78 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C NCB2Q92317 146 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C NUP192P47054 1683 aa1.89□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data1.88□□□□□ -2.11not detected
CSE4YKL049C VPH2P32341 215 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YKL162CP36052 402 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C AIM29P36154 155 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YAP3P38749 330 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C AIM20P40451 204 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C HSH155P49955 971 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C OKP1P53298 406 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C LAG2Q92325 660 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PDR18P53756 1333 aa1.88□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CDC37P06101 506 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RAD3P06839 778 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MET2P08465 486 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CDC42P19073 191 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SEC14P24280 304 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MIG1P27705 504 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C UTR5P32630 166 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MRPL6P32904 214 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C GPX1P36014 167 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ILM1P47155 203 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C UFD1P53044 361 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C GRX3Q03835 250 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CAB5Q03941 241 aa1.87□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C FRS2P15625 503 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C VMA2P16140 517 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPO26P20435 155 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MRPS28P21771 286 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PRE7P23724 241 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RAD51P25454 400 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPS0AP32905 252 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YKT6P36015 200 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MCH2P36032 473 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SWC5P38326 303 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SIP3P38717 1229 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C END3P39013 349 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PES4P39684 611 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YGR266WP53326 701 aa1.86□□□□□ -2.11
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