RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	MAP9	Q49MG5	647 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CARF	Q8N187	725 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	POLH	Q9Y253	713 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ALDH1A2	O94788	518 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ZBED1	O96006	694 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	GYPE	P15421	78 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CSF2RB	P32927	897 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CDC42EP1	Q00587	391 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	UBE3C	Q15386	1083 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TDP1	Q9NUW8	608 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TUSC2	O75896	110 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PER3	P56645	1201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LINC00310	P59036	64 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FAM193A	P78312	1265 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ADAM15	Q13444	863 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RAB39A	Q14964	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RGMA	Q96B86	450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FFAR3	O14843	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TEX33	O43247	280 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PAX4	O43316	350 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	B3GALT2	O43825	422 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	UBXN7	O94888	489 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	KRT1	P04264	644 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RHCE	P18577	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CACNB3	P54284	484 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RHD	Q02161	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DUSP2	Q05923	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PICALM	Q13492	652 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	NFYC	Q13952	458 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	KCNA10	Q16322	511 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PKN1	Q16512	942 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	DPF2	Q92785	391 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	PTPN18	Q99952	460 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TLR9	Q9NR96	1032 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	C2orf78	A6NCI8	922 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	TPP1	O14773	563 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EP300-208	ENST00000635538	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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