RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PDE9AO76083 593 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SLC4A1P02730 911 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ARFIP2P53365 341 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 HACD3Q9P035 362 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PSMC3P17980 439 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC31Q6UY01 552 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KRT77Q7Z794 578 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TMC2Q8TDI7 906 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CALN1Q9BXU9 219 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TAP1Q03518 808 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC103Q8IW40 242 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SCN3BQ9NY72 215 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF197O14709 1029 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FBLN1P23142 703 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PGM1P36871 562 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SDE2Q6IQ49 451 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO11Q86XK2 927 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 WWP1Q9H0M0 922 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD9Q5K651 1589 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH1B1P30837 517 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CAPZA2P47755 286 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAF2Q96CS3 445 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 JAG2Q9Y219 1238 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD14O00487 310 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ADCY1Q08828 1119 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC3Q5W041 872 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 WDR19Q8NEZ3 1342 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 S100GP29377 79 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RAB2AP61019 212 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DDB1Q16531 1140 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MFN1Q8IWA4 741 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 HIPK4Q8NE63 616 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FLCNQ8NFG4 579 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 WWP2O00308 870 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC6O75061 913 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PLCG1P19174 1290 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 HSPH1Q92598 858 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATG3Q9NT62 314 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TAF5LO75529 589 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ACADSP16219 412 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RESTQ13127 1097 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BBS9Q3SYG4 887 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 APOA5Q6Q788 366 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SZRD1Q7Z422 152 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GPR108Q9NPR9 543 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 AGTP01019 485 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 RASA1P20936 1047 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PSMA2P25787 234 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC130P13994 396 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PSMC6P62333 389 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCNYQ8ND76 341 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 IL6P05231 212 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MXI1P50539 228 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GYS2P54840 703 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CORO7P57737 925 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DYNLT1P63172 113 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCNA1P78396 465 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms