RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MARCH5Q9NX47 278 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NEDD4P46934 1319 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MAN2B1O00754 1011 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 C2CD2LO14523 706 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TGM5O43548 720 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ECI2O75521 394 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZMYND10O75800 440 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 VTNP04004 478 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31D3P0C874 917 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PTGDRQ13258 359 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NOMO2Q5JPE7 1267 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD6Q86V97 674 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ITFG1Q8TB96 612 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 GAB3Q8WWW8 586 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MBOAT7Q96N66 472 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.24□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LNP1A1A4G5 178 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 STAT5BP51692 787 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 WDR44Q5JSH3 913 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.23□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NOTCH4Q99466 2003 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 HBP1O60381 514 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 HMMRO75330 724 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PHKA2P46019 1235 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 GLUD2P49448 558 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SLC26A2P50443 739 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DSG1Q02413 1049 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 POTEHQ6S545 545 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LPPQ93052 612 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 KAT14Q9H8E8 782 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.22□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TK2O00142 265 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DDHD2O94830 711 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 FGAP02671 866 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 FCARP24071 287 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ACTR2P61160 394 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SLC20A2Q08357 652 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SCAPQ12770 1279 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MTMR1Q13613 665 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZS52 159 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DEFB124Q8NES8 71 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 FAM3CQ92520 227 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 GBP3Q9H0R5 595 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DACT1Q9NYF0 836 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 EVPLQ92817 2033 aa13.21□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 ATG7O95352 703 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 POU2F2P09086 479 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 HOXA9P31269 272 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 GBP4Q96PP9 640 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 CHST7Q9NS84 486 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.2□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 KLRF2D3W0D1 207 aa13.19□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 PIK3CDO00329 1044 aa13.19□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 MEIS2O14770 477 aa13.19□□□□□ -0.3
HCG18-241ENST00000602290 NRP1O14786 923 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms