RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 VSNL1P62760 191 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD6Q96KE9 485 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 FGFR4P22455 802 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF185O15231 689 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 E2F6O75461 281 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY1A3Q02108 690 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 EMSYQ7Z589 1322 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 F8W8V4 182 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SFNP31947 248 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KRT17Q04695 432 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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PTPRM-211ENST00000580170 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 HUS1O60921 280 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 AP1B1Q10567 949 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 AMACRQ9UHK6 382 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA3FQ13275 785 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 TTC8Q8TAM2 541 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 KCNB1Q14721 858 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 MORF4L2Q15014 288 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA4O75676 772 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.64■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 FOXO4P98177 505 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 POU5F1BQ06416 359 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 BEST2Q8NFU1 509 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KDM1AO60341 852 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 ING2Q9H160 280 aa22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 COL15A1P39059 1388 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 DONSONQ9NYP3 566 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRM-211ENST00000580170 ECE2O60344 883 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PARVAQ9NVD7 372 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 NDE1Q9NXR1 346 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 PSMC5P62195 406 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 ASAP2O43150 1006 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 C21orf2O43822 256 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-211ENST00000580170 KCNA4P22459 653 aa22.61■■□□□ 1.21
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