RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	VSNL1	P62760	191 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PDIA5	Q14554	519 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MTF1	Q14872	753 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	POU4F3	Q15319	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CLUL1	Q15846	466 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MED15	Q96RN5	788 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	VPS18	Q9P253	973 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	FLT1	P17948	1338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346		B4DLN1	442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346		H3BQF6	201 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	KLRC4	O43908	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ZEB2	O60315	1214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TCF3	P15923	654 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PLCG1	P19174	1290 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ARNT	P27540	789 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	USP8	P40818	1118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	EPS15	P42566	896 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NOV	P48745	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ADCY7	P51828	1080 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SOX10	P56693	466 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	HERVK_113	P62684	666 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TFAP4	Q01664	338 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	TRAF1	Q13077	416 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PAK2	Q13177	524 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ITPK1	Q13572	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GRAP	Q13588	217 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CALCRL	Q16602	461 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	INF2	Q27J81	1249 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NSF-208	ENST00000576346	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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