RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 MUTP22033 750 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 GIT2Q14161 759 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 PDIA5Q14554 519 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 PADI6Q6TGC4 694 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 RNF135Q8IUD6 432 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 SUSD6Q92537 303 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 S1PR5Q9H228 398 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 STK39Q9UEW8 545 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 HES2Q9Y543 173 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 ARL5CA6NH57 179 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 B4GALT5O43286 388 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 PTGDRQ13258 359 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 GAD1Q99259 594 aa24.89■■□□□ 1.58
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CLN3-215ENST00000565236 APOL5Q9BWW9 433 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 RAB34Q9BZG1 259 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 IRAK3Q9Y616 596 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-215ENST00000565236 A0A1B0GUA9 196 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 PRR33A8MZF0 331 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 NRP1O14786 923 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 CYP11B2P19099 503 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 MCTP1Q6DN14 999 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 STK24Q9Y6E0 443 aa24.88■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 NPTXRO95502 500 aa24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 MLH1P40692 756 aa24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 TMX3Q96JJ7 454 aa24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 INPPL1O15357 1258 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 OR1G1P47890 313 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 ECM1Q16610 540 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.86■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 FZD8Q9H461 694 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.86■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa24.86■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 SCNN1GP51170 649 aa24.85■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.85■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.85■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.85■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 FAM187BQ17R55 369 aa24.84■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 BSNDQ8WZ55 320 aa24.84■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 IFT74Q96LB3 600 aa24.84■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.84■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 H3BQV1 296 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 MCM2P49736 904 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 DSC1Q08554 894 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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CLN3-215ENST00000565236 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 DNM3Q9UQ16 869 aa24.83■■□□□ 1.57
CLN3-215ENST00000565236 N4BP3O15049 544 aa24.82■■□□□ 1.56
CLN3-215ENST00000565236 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CLN3-215ENST00000565236 EPCAMP16422 314 aa24.82■■□□□ 1.56
CLN3-215ENST00000565236 LIG1P18858 919 aa24.82■■□□□ 1.56
CLN3-215ENST00000565236 KLRC2P26717 231 aa24.82■■□□□ 1.56
CLN3-215ENST00000565236 GJB2P29033 226 aa24.82■■□□□ 1.56
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