RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA1Q5VX52 437 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 DRC7Q8IY82 874 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 SV2BQ7L1I2 683 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SPC24Q8NBT2 197 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 LENG9Q96B70 501 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM9Q9C026 710 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-204ENST00000548823 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 IER5Q5VY09 327 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 MED15Q96RN5 788 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.01■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 PADI3Q9ULW8 664 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 POTEMA6NI47 508 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT37O76014 449 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 SP4Q02446 784 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 MARCH8Q5T0T0 291 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 RAD54LQ92698 747 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 LZTS1Q9Y250 596 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 GSDMDP57764 484 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PRR16Q569H4 304 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CES5AQ6NT32 575 aa21.99■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.99■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 POMKQ9H5K3 350 aa21.99■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM86B1E9PN63 330 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP1A3P13637 1013 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ITIH3Q06033 890 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PAK2Q13177 524 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 STIM1Q13586 685 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ERMNQ8TAM6 284 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PLIN2Q99541 437 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 M0QZ92 97 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 SERPINC1P01008 464 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF76P36508 570 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 UBASH3AP57075 661 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PAK1Q13153 545 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CASP10Q92851 521 aa21.98■■□□□ 1.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CDH22Q9UJ99 828 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 MSH4O15457 936 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 ASGR2P07307 311 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 AOC1P19801 751 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-204ENST00000548823 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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