RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SKIP12755 728 aa11.53□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NT5C2P49902 561 aa11.53□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRM2Q14416 872 aa11.53□□□□□ -0.56
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCEAL3Q969E4 200 aa11.53□□□□□ -0.56
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRP2Q13474 957 aa11.52□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.52□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM3CQ92520 227 aa11.52□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.52□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.52□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.52□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERICH2A1L162 156 aa11.51□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf47A7E2U8 309 aa11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAN2B1O00754 1011 aa11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.51□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC24BO95487 1268 aa11.5□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8AP07357 584 aa11.5□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.5□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KBTBD6Q86V97 674 aa11.5□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.5□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.5□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F5P12259 2224 aa11.5□□□□□ -0.57
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNE1P24864 410 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB27AP51159 221 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE1AP54750 535 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRDNQ13061 729 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP41Q3LFD5 358 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZS52 159 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KSR1Q8IVT5 923 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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