RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 LARGE1O95461 756 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 EFEMP2O95967 443 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 POMCP01189 267 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 SOD2P04179 222 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 NEFLP07196 543 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 ARL2P36404 184 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 CLCN4P51793 760 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 NUBP1P53384 320 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 COLGALT2Q8IYK4 626 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 MTMR9Q96QG7 549 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 CSRNP2Q9H175 543 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 CACNA1HO95180 2353 aa26.7■■□□□ 1.87
ACER3-211ENST00000531461 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 BTBD18B2RXH4 712 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 NEMFO60524 1076 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 AVPR2P30518 371 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RARRES1P49788 294 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 DSC1Q08554 894 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TCF15Q12870 199 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CAPSQ13938 189 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 AMHR2Q16671 573 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GPR149Q86SP6 731 aa26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ARL5CA6NH57 179 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 WEE2P0C1S8 567 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 MARCH5Q9NX47 278 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.69■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 BRD1O95696 1058 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 KLRC2P26717 231 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 VCPP55072 806 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 KANK3Q6NY19 840 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GAD1Q99259 594 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RNF39Q9H2S5 420 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.68■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 WNT7AO00755 349 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GLRA2P23416 452 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TXKP42681 527 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TRIM29Q14134 588 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 HACE1Q8IYU2 909 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CPB2Q96IY4 423 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.67■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 C1RP00736 705 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 URODP06132 367 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 MLH1P40692 756 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 DPP7Q9UHL4 492 aa26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 USP34Q70CQ2 3546 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 A0A1B0GUA9 196 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 JAK2O60674 1132 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 OR1G1P47890 313 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 NEK4P51957 841 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0319Q5VV43 1072 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GPR65Q8IYL9 337 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ZFP42Q96MM3 310 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 RXFP1Q9HBX9 757 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 MIOSQ9NXC5 875 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 HES2Q9Y543 173 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PLXNA3P51805 1871 aa26.65■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 NR1I2O75469 434 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PAPLNO95428 1278 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ADH1AP07327 375 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 SCNN1GP51170 649 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.64■■□□□ 1.86
ACER3-211ENST00000531461 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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