RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 TGDSO95455 350 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MX2P20592 715 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP6V1E1P36543 226 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CYP4X1Q8N118 509 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ST8SIA4Q92187 359 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 C16orf92Q96LL3 132 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TIGD1Q96MW7 591 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM160Q9NX00 188 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAN2B1O00754 1011 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 NDST3O95803 873 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BMP1P13497 986 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MTHFD2P13995 350 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MC4RP32245 332 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FGL2Q14314 439 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PANK1Q8TE04 598 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHST7Q9NS84 486 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CPA4Q9UI42 421 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 IGF1RP08069 1367 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 H3BUI4 141 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FSBPO95073 299 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADH7P40394 386 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CUL4AQ13619 759 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CUL4BQ13620 913 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GRIK5Q16478 980 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM182BQ5T319 152 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC22A25Q6T423 547 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LCA5Q86VQ0 697 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAB24Q969Q5 203 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACSS2Q9NR19 701 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 COL20A1Q9P218 1284 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.25□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HMX3A6NHT5 357 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SIGLEC6O43699 453 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTP4A3O75365 173 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SGPL1O95470 568 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRKAA2P54646 552 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMF1P82094 1093 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLS1Q14651 629 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 RASA2Q15283 850 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 KAZNQ674X7 775 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CREG2Q8IUH2 290 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSPYL6Q8N831 410 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MIPEPQ99797 713 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MXD3Q9BW11 206 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CD244Q9BZW8 370 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACAD9Q9H845 621 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAFFQ9ULX9 164 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHL1O00533 1208 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PODXLO00592 558 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 PIP5K1BO14986 540 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 CYP17A1P05093 508 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP6V1B1P15313 513 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 NPR1P16066 1061 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 BCL6P41182 706 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 HSD17B7P56937 341 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAM9Q13443 819 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCARB2Q14108 478 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR19Q15760 415 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.24□□□□□ -1.41
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms