RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGA1P56199 1179 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 RTP5Q14D33 572 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 STK32CQ86UX6 486 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB24Q969Q5 203 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 TDP1Q9NUW8 608 aa9.55□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 F5H423 210 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A9P48067 706 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42EP1Q00587 391 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf20Q8ND61 904 aa9.54□□□□□ -0.88
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PGGT1B-205ENST00000514178 SAMD11Q96NU1 681 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 STAP2Q9UGK3 403 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.54□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 FRS3O43559 492 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 PRAMEF4O60810 478 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 PPFIA4O75335 1185 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 MYF5P13349 255 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF2P15336 505 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 MST1LQ2TV78 715 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZVL8 140 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 ABI1Q8IZP0 508 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2C3Q8N628 320 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 POF1BQ8WVV4 589 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 PHKBQ93100 1093 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 APIPQ96GX9 242 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR92Q96MX6 357 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 CLIC6Q96NY7 704 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.53□□□□□ -0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.53□□□□□ -0.88
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PGGT1B-205ENST00000514178 KPNA5O15131 536 aa9.52□□□□□ -0.89
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PGGT1B-205ENST00000514178 MAN2A1Q16706 1144 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.52□□□□□ -0.89
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PGGT1B-205ENST00000514178 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35A4Q96G79 324 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 Q9UFV3 132 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BUI4 141 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-205ENST00000514178 GAAP10253 952 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE3CQ15386 1083 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF605Q86T29 641 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX33Q8WV41 574 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-205ENST00000514178 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO10Q9UK96 956 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 CROTQ9UKG9 612 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 FGAP02671 866 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 SYN1P17600 705 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 HALP42357 657 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 BTKQ06187 659 aa9.5□□□□□ -0.89
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