RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 KINO60870 393 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ERLIN2O94905 339 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 DSG1Q02413 1049 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 UBXN11Q5T124 520 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 GAD1Q99259 594 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 PRKD2Q9BZL6 878 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 MARCH5Q9NX47 278 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 NUMBLQ9Y6R0 609 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ARL5CA6NH57 179 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ANHXE9PGG2 379 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ASAP2O43150 1006 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 TGM5O43548 720 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 TDP2O95551 362 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 C1RP00736 705 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 CPA1P15085 419 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 CYP3A7P24462 503 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 QARSP47897 775 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 NPEPPSP55786 919 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 MINDY3Q9H8M7 445 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 FSHRP23945 695 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 MLH1P40692 756 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 RFC5P40937 340 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 STARD6P59095 220 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 GPC5P78333 572 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 HTR4Q13639 388 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 USP41Q3LFD5 358 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF149Q8NC42 400 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 PJA1Q8NG27 643 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 TCP11Q8WWU5 503 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 ATRIPQ8WXE1 791 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 BORCS6Q96GS4 357 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 BCO2Q9BYV7 579 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 FOXQ1Q9C009 403 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 CHST7Q9NS84 486 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 NCDNQ9UBB6 729 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 IPPQ9Y573 584 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 DMXL1Q9Y485 3027 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR81Q562E7 1941 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 LAMTOR5O43504 91 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SDHBP21912 280 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 AXLP30530 894 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 HACE1Q8IYU2 909 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 B3GALT6Q96L58 329 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 APOL6Q9BWW8 343 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF39Q9H2S5 420 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 FNIP2Q9P278 1114 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 PPME1Q9Y570 386 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 TADA2AO75478 443 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 IFNAR1P17181 557 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SCNN1GP51170 649 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 CREMQ03060 361 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 DSC1Q08554 894 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 NTRK3Q16288 839 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 NOTUMQ6P988 496 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SUMF1Q8NBK3 374 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 ZFP42Q96MM3 310 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 MIOSQ9NXC5 875 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 HES2Q9Y543 173 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP2-215ENST00000510074 POTEMA6NI47 508 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms