RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPH1Q70E73 1250 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDK4P11802 303 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTN1P12814 892 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ADORA2AP29274 412 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HNF1BP35680 557 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT83P78385 493 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ROR1Q01973 937 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GNA13Q14344 377 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB30Q15771 203 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MDM1Q8TC05 714 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DRC3Q9H069 523 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP72Q9P209 647 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NDC80O14777 642 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SUPT3HO75486 399 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.628e-15■■■■□ 24
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RABGGTB-213ENST00000496055 OLFM2O95897 454 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5JP18859 108 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE6CP51160 858 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC13P55735 322 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RAC1P63000 192 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FPGSQ05932 587 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MORN1Q5T089 497 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R18Q6NYC8 613 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LBX2Q6XYB7 198 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EDARQ9UNE0 448 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARAP2Q8WZ64 1704 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ASB14A6NK59 587 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF28PB7ZC32 967 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NCAM2O15394 837 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TMCC1O94876 653 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 APBB3O95704 486 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A6P06703 90 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CLTBP09497 229 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 CTHP32929 405 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY8P40145 1251 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTM4Q03013 218 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA3AQ14563 771 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD1Q15327 319 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LZICQ8WZA0 190 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NXPE3Q969Y0 559 aa4.93□□□□□ -1.62
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